Anthropic zufolge nutzte sein Biologieteam Claude, um die erste 3D-Struktur eines bakteriellen Vault-Partikels zu bestimmen
Anthropic hat einen Bericht veröffentlicht und ein Preprint bei bioRxiv eingereicht, in dem beschrieben wird, wie das Life-Sciences-Team gemeinsam mit Claude die erste 3D-Struktur eines Vault-Partikels aus einem Prokaryoten bestimmte. Vaults sind große, hohle, tonnenförmige Proteinhüllen, die erstmals 1986 beschrieben wurden; ihre Funktion ist nach wie vor unbekannt.
Anthropic zufolge können Vault-ähnliche Proteine aus Bakterien und den Viren, die sie infizieren, vollständige Vaults bilden. Die entschlüsselte Struktur stammt von einem Bakteriophagenprotein namens L05: 96 Kopien, etwa 54 mal 45 Nanometer groß, und mit einem Innenvolumen, das etwa 25 % größer ist als das eines Säugetier-Vaults. Strukturen dieser einfacheren Organismen könnten es erleichtern, die Funktion von Vaults in menschlichen Zellen zu untersuchen, so Anthropic.
Zu Claudes Rolle sagt Anthropic, Claude habe eine Datenbank mit etwa 15 Milliarden vorhergesagten Proteinen durchsucht, DNA-Konstrukte entworfen, eine schnellere Isolierungsmethode vorgeschlagen, durch die sich eine Aufreinigung von etwa drei Tagen auf rund 90 Minuten verkürzte, und die Kryo-EM-Datenverarbeitung durchgeführt. Das erste Strukturmodell sei 34 Stunden nach Beginn der Verarbeitung fertig gewesen, die endgültigen Karten etwa eine Woche später. Anthropic sagt außerdem, Claude habe unterwegs Fehler gemacht, darunter ein Protokoll, das das Team zwei Wochen kostete, und eine fehlerhafte frühe Karte. Zudem habe Claude seine Labornotizen mit den ML-Forschenden geteilt, die Claude trainieren. Dies sind Behauptungen von Anthropic selbst.
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