Anthropic、細菌のボールト粒子の初の3D構造解明にClaudeを活用したと発表

Anthropicは、ライフサイエンスチームがClaudeと協力し、原核生物由来のボールト粒子の初の3D構造を解明した経緯について、bioRxivにプレプリントを投稿するとともに記事を公開した。ボールトは大きく、中空で、樽形をしたタンパク質の殻で、1986年に初めて報告された。その機能は今も不明だ。

Anthropicによると、細菌や、それらに感染するウイルスに由来するボールト様タンパク質は、完全なボールトを形成できる。同社が解明した構造は、L05と呼ぶバクテリオファージのタンパク質に由来する。96個のコピーからなり、大きさは約54×45ナノメートルで、哺乳類のボールトより約25%多い体積を内包するという。こうした単純な生物に由来する構造を調べることで、ヒト細胞内のボールトの機能を解明しやすくなる可能性があるとしている。

Claudeの役割についてAnthropicは、Claudeが約150億個の予測タンパク質を収録したデータベースを検索し、DNAコンストラクトを設計し、精製にかかる時間を約3日から約90分に短縮する、より速い単離法を提案し、クライオ電子顕微鏡（cryo-EM）のデータ処理を実行したと説明している。処理開始から34時間後に最初の構造モデルが完成し、最終マップは約1週間後に得られたという。また、Claudeは途中で誤りも犯し、チームに2週間の損失をもたらしたプロトコルや、初期段階の不正確なマップもあったと述べている。さらに、Claudeの学習を担当するML研究者たちに研究記録を共有したという。これらはAnthropic自身の主張だ。